Dalam rangka memotivasi, meningkatkan budaya mutu serta prestasi pendidikan Muhammadiyah, majelis DIKDASMEN dan PNF PP Muhammadiyah melalui forum guru Muhammadiyah (FGM) dan PWM Jawa Tengah menyelenggarakan kegiatan Olimpiade Muhammadiyah Berprestasi Nasional (OMBN 2025). Dengan mengambil tema “ONBM 2025 Berprestasi, Berkarakter Dan Berkemajuan” kegiatan tersebut dilaksanakan mulai tanggal 25-26 Januari 2025 di Universitas Muhammadiyah Semarang. Sebelum mengikuti olimpiade tingkat nasional, sekolah sekolah secara berjenjang mengikuti seleksi tingkat kabupaten/kota dan provinsi. Dalam kesempatan ini SMA Muhammadiyah Kupang mengirimkan perwakilan siswa siswinya untuk kategori mata pelajaran :
- Khalid Lamen (Olimpiade Mapel Kimia)
- Nyai Hurizza Suttan (Olimpiade Mapel Biologi)
- Suci Rahmadani (Olimpiade Mapel Matematika)
- Arumi Baco (Lomba Hifdzil Qur’an)
- Ci Puan Maharani Malongi (Lomba Hifdzil Qur’an)
- Imaya Salama Natonis (Lomba Olimpiade Mapel Ekonomi)
- Fahril Arahman Gasim (Olimpiade Mapel Geografi)
- Sri Siti Salmiah (Olimpiade Mapel Fisika)
Untuk penilaian masing-masing kab./kota akan di ranking 5 (lima) peserta terbaik (terdiri dari juara 1 : 1 orang, juara 2 : 2 orang, juara 3 : 2 orang) dan atau peserta yang masuk passing grade akan diikutkan dalam OMBN Tingkat Provinsi. Dalam seleksi tingkat kabupaten/kota yang dilaksanakan tanggal 21 Desember 2024, dari 6 kategori mata pelajaran yang dilombakan pada tanggal tersebut SMA Muhammadiyah Kupang meloloskan 4 siswa/i nya untuk mengikuti seleksi tingkat provinsi yang dilaksanakan tanggal 11 Januari 2025. Disampaikan oleh Mukhtar Mele, SE, kepala sekolah SMA Muhamamdiyah Kupang, kegiatan ini merupakan ajang untuk menimba pengalaman bagi siswa serta mengukur sampai sejauh mana keberhasilan pembelajaran di sekolah.